Tuckerman, Mark E.: шукати на сайті Z-Library

Hayes, Robin L., Paddison, Stephen J., Tuckerman, Mark E.

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.20 MB

english, 2009

Proton Transport in Triflic Acid Pentahydrate Studied via Ab Initio Path Integral Molecular Dynamics

Журнал:

Journal of Physical Chemistry A

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.87 MB

english, 2011

Stochastic, resonance-free multiple time-step algorithm for molecular dynamics with very large time steps

Leimkuhler, Ben, Margul, Daniel T., Tuckerman, Mark E.

Журнал:

Molecular Physics

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 998 KB

english, 2013

[WORLD SCIENTIFIC Proceedings of the International School of Physics - LERICI, Villa Marigola (7 – 18 July 1997)] Classical and Quantum Dynamics in Condensed Phase Simulations - Path integral molecular dynamics: a computational approach to quantum statistical mechanics

TUCKERMAN, MARK E., HUGHES, ADAM

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.03 MB

english

Bypassing the Kohn-Sham equations with machine learning

Brockherde, Felix, Vogt, Leslie, Li, Li, Tuckerman, Mark E., Burke, Kieron, Müller, Klaus-Robert

Журнал:

Nature Communications

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.32 MB

english, 2017

Measure-preserving integrators for molecular dynamics in the isothermal–isobaric ensemble derived from the Liouville operator

Tang-Qing Yu, José Alejandre, Roberto López-Rendón, Glenn J. Martyna, Mark E. Tuckerman

Журнал:

Chemical Physics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.31 MB

english, 2010

Nosé–Hoover chains: The canonical ensemble via continuous dynamics

Martyna, Glenn J., Klein, Michael L., Tuckerman, Mark

Журнал:

Chen, Ming, Cuendet, Michel A., Tuckerman, Mark E.

Рік:

1992

Мова:

english

Файл:

PDF, 821 KB

english, 1992

Heating and flooding: A unified approach for rapid generation of free energy surfaces

Журнал:

Tuckerman, Mark E., Marx, Dominik, Klein, Michael L., Parrinello, Michele

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.08 MB

english, 2012

Efficient and general algorithms for path integral Car–Parrinello molecular dynamics

Журнал:

Minary, Peter, Tuckerman, Mark E., Martyna, Glenn J.

Рік:

1996

Мова:

english

Файл:

PDF, 465 KB

english, 1996

Dynamical Spatial Warping: A Novel Method for the Conformational Sampling of Biophysical Structure

Журнал:

SIAM Journal on Scientific Computing

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 1012 KB

english, 2008

10.1038/17579

Marx, Dominik, Tuckerman, Mark E., Hutter, Jürg, Parrinello, Michele

Журнал:

Nature

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 475 KB

english, 1999

A reciprocal space based method for treating long range interactions in ab initio and force-field-based calculations in clusters

Martyna, Glenn J., Tuckerman, Mark E.

Журнал:

von Lilienfeld, O. Anatole, Tuckerman, Mark E.

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 537 KB

english, 1999

Molecular grand-canonical ensemble density functional theory and exploration of chemical space

Журнал:

Tuckerman, Mark E., Liu, Yi, Ciccotti, Giovanni, Martyna, Glenn J.

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 560 KB

english, 2006

Non-Hamiltonian molecular dynamics: Generalizing Hamiltonian phase space principles to non-Hamiltonian systems

Журнал:

Tuckerman, Mark E., Berne, Bruce J., Martyna, Glenn J.

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 628 KB

english, 2001

Molecular dynamics algorithm for multiple time scales: Systems with long range forces

Журнал:

Marx, Dominik, Chandra, Amalendu, Tuckerman, Mark E.

Рік:

1991

Мова:

english

Файл:

PDF, 686 KB

english, 1991

Aqueous Basic Solutions: Hydroxide Solvation, Structural Diffusion, and Comparison to the Hydrated Proton

Журнал:

Chemical Reviews

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.63 MB

english, 2010

Ab Initio Molecular Dynamics Study of the Aqueous HOO – Ion

Ma, Zhonghua, Anick, David, Tuckerman, Mark E.

Журнал:

Tuckerman, Mark E., Martyna, Glenn J., Berne, Bruce J.

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.85 MB

english, 2014

Molecular dynamics algorithm for condensed systems with multiple time scales

Журнал:

Martyna, Glenn J., Hughes, Adam, Tuckerman, Mark E.

Рік:

1990

Мова:

english

Файл:

PDF, 560 KB

english, 1990

Molecular dynamics algorithms for path integrals at constant pressure

Журнал:

Martyna, Glenn J., Tuckerman, Mark E.

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 575 KB

english, 1999

Symplectic reversible integrators: Predictor–corrector methods

Журнал:

Pérez, Alejandro, Tuckerman, Mark E., Müser, Martin H.

Рік:

1995

Мова:

english

Файл:

PDF, 454 KB

english, 1995

A comparative study of the centroid and ring-polymer molecular dynamics methods for approximating quantum time correlation functions from path integrals

Журнал:

Schneider, Elia, Dai, Luke, Topper, Robert Q., Drechsel-Grau, Christof, Tuckerman, Mark E.

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 481 KB

english, 2009

Stochastic Neural Network Approach for Learning High-Dimensional Free Energy Surfaces

Журнал:

Physical Review Letters

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 679 KB

english, 2017

Molecular dynamics based enhanced sampling of collective variables with very large time steps

Chen, Pei-Yang, Tuckerman, Mark E.

Журнал:

Zelovich, Tamar, Vogt-Maranto, Leslie, Hickner, Michael A., Paddison, Stephen J., Bae, Chulsung, Dekel, Dario R., Tuckerman, Mark E.

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.30 MB

english, 2018

Hydroxide Ion Diffusion in Anion Exchange Membranes at Low Hydration: Insights from Ab initio Molecular Dynamics

Журнал:

Chemistry of Materials

Рік:

2019

Файл:

PDF, 937 KB

2019

Comparison of the Performance of Machine Learning Models in Representing High-Dimensional Free Energy Surfaces and Generating Observables

Cendagorta, Joseph R., Tolpin, Jocelyn, Schneider, Elia, Topper, Robert Q., Tuckerman, Mark E.

Журнал:

Рік:

2020

Файл:

PDF, 2.76 MB

2020

Liquid Structure and Transport Properties of the Deep Eutectic Solvent Ethaline

Zhang, Yong, Poe, Derrick, Heroux, Luke, Squire, Henry, Doherty, Brian W., Long, Zhuoran, Dadmun, Mark D., Gurkan, Burcu E., Tuckerman, Mark E., Maginn, Edward J.

Журнал:

Radu Iftimie, Mark E. Tuckerman

Рік:

2020

Файл:

PDF, 2.31 MB

2020

The Molecular Origin of the “Continuous” Infrared Absorption in Aqueous Solutions of Acids: A Computational Approach

Журнал:

Angewandte Chemie

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 179 KB

english, 2006

The Molecular Origin of the “Continuous” Infrared Absorption in Aqueous Solutions of Acids: A Computational Approach

Radu Iftimie, Mark E. Tuckerman

Журнал:

Angewandte Chemie International Edition

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 179 KB

english, 2006

The Nature and Transport Mechanism of Hydrated Hydroxide Ions in Aqueous Solution

Mark E. Tuckerman, Dominik Marx, Michele Parrinello

Журнал:

ChemInform

Рік:

2002

Файл:

PDF, 25 KB

2002

Efficient Evaluation of Nonlocal Pseudopotentials via Euler Exponential Spline Interpolation

Hee-Seung Lee, Mark E. Tuckerman, Glenn J. Martyna

Журнал:

ChemPhysChem

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 158 KB

english, 2005

Scalable fine-grained parallelization of plane-wave–based ab initio molecular dynamics for large supercomputers

Ramkumar V. Vadali, Yan Shi, Sameer Kumar, Laxmikant V. Kale, Mark E. Tuckerman, Glenn J. Martyna

Журнал:

Journal of Computational Chemistry

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 516 KB

english, 2004

Hydroxide anion at the air–water interface

Christopher J. Mundy, I-Feng W. Kuo, Mark E. Tuckerman, Hee-Seung Lee, Douglas J. Tobias

Журнал:

Joseph A. Morrone, Mark E. Tuckerman

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 449 KB

english, 2009

A simple quantum mechanical/molecular mechanical (QM/MM) model for methanol

Журнал:

Mark E. Tuckerman, Michael L. Klein

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 133 KB

english, 2003

Ab initio molecular dynamics study of solid nitromethane

Журнал:

Mark E. Tuckerman, D.A. Yarne, Shane O. Samuelson, Adam L. Hughes, Glenn J. Martyna

Рік:

1998

Мова:

english

Файл:

PDF, 99 KB

english, 1998

Exploiting multiple levels of parallelism in Molecular Dynamics based calculations via modern techniques and software paradigms on distributed memory computers

Журнал:

Computer Physics Communications

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 666 KB

english, 2000

Quantum dynamics via adiabatic ab initio centroid molecular dynamics

Dominik Marx, Mark E. Tuckerman, Glenn J. Martyna

Журнал:

Computer Physics Communications

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.18 MB

english, 1999

Effect of N–H⋯S amide–thiolate hydrogen bonding on bond lengths in rubredoxin models [(CH3)3NCH2CONH2]2[M(S2-o-xyl)2]

Wesley P. Chung, John C. Dewan, Mark Tuckerman, Marc A. Walters

Журнал:

Inorganica Chimica Acta

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 114 KB

english, 1999

Direct evidence of an anomalous charge transport mechanism in ammonium perchlorate crystal in an ammonia-rich atmosphere from first-principles molecular dynamics

Lula Rosso, Mark E. Tuckerman

Журнал:

Solid State Ionics

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 763 KB

english, 2003

Structural and dynamical behavior of an azide anion in water from ab initio molecular dynamics calculations

Dawne A Yarne, Mark E Tuckerman, Michael L Klein

Журнал:

Chemical Physics

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 180 KB

english, 2000

The nature and transport mechanism of hydrated hydroxide ions in aqueous solution

Tuckerman, Mark E., Marx, Dominik, Parrinello, Michele

Журнал:

Nature

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 321 KB

english, 2002

Structure of liquid water at ambient temperature from ab initio molecular dynamics performed in the complete basis set limit

Lee, Hee-Seung, Tuckerman, Mark E.

Журнал:

Tuckerman, Mark, Laasonen, Kari, Sprik, Michiel, Parrinello, Michele

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 711 KB

english, 2006

Ab Initio Molecular Dynamics Simulation of the Solvation and Transport of H3O+ and OH- Ions in Water

Журнал:

Journal of Physical Chemistry

Рік:

1995

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.25 MB

english, 1995

Enol Tautomers of Watson−Crick Base Pair Models Are Metastable Because of Nuclear Quantum Effects

Pérez, Alejandro, Tuckerman, Mark E., Hjalmarson, Harold P., von Lilienfeld, O. Anatole

Журнал:

Journal of the American Chemical Society

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 883 KB

english, 2010

On the connection between proton transport, structural diffusion, and reorientation of the hydrated hydroxide ion as a function of temperature

Zhonghua Ma, Mark E. Tuckerman

Журнал:

Cuendet, Michel A., Tuckerman, Mark E.

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 738 KB

english, 2011

Alchemical Free Energy Differences in Flexible Molecules from Thermodynamic Integration or Free Energy Perturbation Combined with Driven Adiabatic Dynamics

Журнал:

Journal of Chemical Theory and Computation

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.85 MB

english, 2012

Mapping the Backbone Dihedral Free-Energy Surfaces in Small Peptides in Solution Using Adiabatic Free-Energy Dynamics

Rosso, Lula, Abrams, Jerry B., Tuckerman, Mark E.

Журнал:

Zhu, Zhongwei, Schuster, David I., Tuckerman, Mark E.

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 313 KB

english, 2005

Molecular Dynamics Study of the Connection between Flap Closing and Binding of Fullerene-Based Inhibitors of the HIV-1 Protease†

Журнал:

Biochemistry

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 156 KB

english, 2003

Generalized Gaussian moment thermostatting: A new continuous dynamical approach to the canonical ensemble

Liu, Yi, Tuckerman, Mark E.

Журнал: